临床上治疗腹泻的药物很多，有专门用于止泻的功能性止泻药，亦有根据病因选用的抗菌药、抗病毒药，以及各种肠粘膜保护剂、微生态调节剂等。上述药物在治疗腹泻中虽然疗效较好，但其中有些药物对于机体发育尚不健全的小儿来说则不宜。鉴于小儿腹泻是儿科常见病、多发病，为人父母者又习惯自行给药，因此有必要讲述一下小儿腹泻不宜选用的药物。
易蒙停 适用于各种病引起的急慢性腹泻的治疗。但其作用强烈，用于低龄儿童易致药物不良反应，如影响中枢神经系统等，加之曾有新生儿用药致死的报道，故国内外均限制用于低龄儿，如我国易蒙停使用说明书中就规定5岁以下儿童禁用。
复方苯乙哌啶 适用于急慢性功能腹泻及慢性肠炎的治疗。该药每片含盐酸地分诺酯2．5毫克、硫酸阿托品0．025毫克，其中地芬诺酯对肠道作用类似吗啡，可直接作用于肠道平滑肌，作用亦很强烈。由于国内外不断有应用该药致小儿中毒甚至致死的报道（死亡病例集中于小于两岁婴幼儿），又因该药小儿用药剂量至今尚无统一标准，因此两岁以下婴幼儿禁用，两岁以上小儿若用亦须慎之，要严格控制用药剂量。
氟哌酸 致病性大肠杆菌、沙门氏菌属等所致的胃肠炎、菌痢有良好疗效，临床应用广泛，为人们熟知。但因该药及其同类（喳诺酮类）药物有引起骨病变的可能，因此，16岁以下小儿不宜选用。
药用炭 能吸附导致腹泻及腹部不适的多种有毒与无毒刺激物，减轻对肠壁的刺激，减少蠕动，从而起到止泻作用。但由于该药吸附作用强且无选择性，对消化酶如胃蛋白酶、胰酶的活性均有影响，长期应用可致小儿营养不良，故3岁以下小儿腹泻或腹胀，禁止长期应用。