检查儿童时，须态度亲切，操作轻柔，方法恰当，有时无须强迫约束，也能顺利进行。
可先将器械的作用简单告诉受检儿童，然后用虚拟动作(如以压舌板轻压其舌背，迅速撤出)，使知检查无痛苦，即可取得合作，进行正式检查。如通过上述方法仍无法进行检查，须请家长或护士协助。协助者坐检查椅上，将儿童抱于怀中，两腿夹住儿童的膝腿，右手握住其手腕，右臂将儿童搂紧，左手按着儿童额部使其头贴靠在协助者的胸部，并注意勿遮挡光源。
检查者对好额镜反光，持压舌板于口旁，待其哭叫之际，或捏鼻孔伺其张口呼吸之时，迅速伸入口腔压其舌根，便可查看口、咽和因恶心而挤向咽部中央的腭扁桃体；有时还可见到喉咽后壁和上升的会厌舌面。必要时，可将压舌板支于一侧上下牙列之间，或用左食指将左侧面颊推入上下牙列间，使保持张口状态。
曾作过咽部或内腔镜检查的儿童，常藉齿缝呼吸，坚不张口。可用弯头咽探子从磨牙后伸入咽部，或经鼻插入导尿管至咽喉搅动，使其产生恶心反射，乘机置入压舌板。
儿童不能用鼻咽镜检查鼻咽部，常须进行触诊以了解增殖体等情况，如上法固定病儿后，检查者立于右侧，用左臂固定其头部于胸臂之间，或置入阻咬器后再进行触诊。检查者用右手指伸入口内，超过软腭，弯向后上方，用指尖触查鼻咽腔，时间不宜超过3～4秒钟。
如小儿烦躁不安，吮乳时啼哭或拒食，声如鸭鸣，说话如口中含物，颈偏一侧，头略后仰，疑为咽后脓肿时，宜置于头低脚高位，作好吸引等准备后再作咽部检查，以免脓肿突然破裂发生危险。