生殖系统青春期前发育缓慢，青春期才开始迅速发育。女孩青春期约12~18岁，男孩约13~20岁，一般划分为3个阶段：
青春期前期：女孩9~11岁，男孩11~13岁，生长明显加速，第二性征出现，此期历经2~3年；
青春期中期：女孩11~16岁，男孩13~18岁，体格生长开始减速，第二性征全部出现，性器官已成熟，初潮、首次遗精来临，此期历经3~4年；
青春期后期：女孩17~21岁， 男孩19~24岁，生长发育停止，第二性征发育完成，历经3~4年。
一、女性生殖系统的发育
女孩自出生时卵巢发育已较完善，但只在性成熟以后，才开始正规排卵（约13~15岁），并伴有周期性子宫内膜脱落出血，即月经。子宫体随年龄而增大，10岁以后增长加快，15岁左右达到成人大小。女孩第二性征出现较早，9~10岁骨盆开始加宽，乳头发育；12岁后臀部变丰满，外生殖器增大，阴道上皮角化、分泌物变酸。随之乳房迅速增大发育，出现腋毛、阴毛，15~16岁时出现痤疮。
二、男性生殖系统的发育
男孩自出生时睾丸大多数已降至阴囊，约有10%尚未下降，一般1岁内都下降至阴囊但到成人仍有0.2%未降，称隐睾。自出生到10岁前这一段时间性器官发育较慢，到青春期开始进一步发育，分泌的雄激素促进第二性征的出现。10~11岁阴茎开始增大，小儿一般包皮包住龟头，包皮口狭窄，到8~10岁包皮可以上翻。12~15岁（性成熟期）开始出成熟的精子，平均在15岁出现第一次射精。13~16岁时出现阴毛、腋毛，声音变粗、开始长胡须和喉结，出现痤疮。
三、性激素对发育的影响
性激素除对性器官及第二性征起作用外，也加速骨骺的发育及骨骺的愈合，影响长骨的发育，女性约在16~17岁，男性17~21岁时骨骼停止生长。雄激素对肌肉的发育也起重要作用。