发酵好的鸡粪怎么施肥，方法参考如下：
1、以果树为例，将发酵好的鸡粪在果树四周沿着树冠离根挖沟，施入后在上面覆盖上一层土。
2、鸡粪中残留的抗生素可以杀灭土壤中的有害真菌、细菌等微生物，有助于减轻果树重茬病的危害，促进新植果树幼树的生长。
鸡粪肥施用时的注意事项：
1、鸡粪不能直接施肥
对果树施用鸡粪施肥时，必须先对鸡粪进行腐熟发酵，然后再施用，以避免果树出现烧根的现象。
鸡粪中含有大量的有机质，但不能直接使用，鸡粪中含有大量的氮，如果未经发酵处理就施用，可能导致烧苗。另外，鸡粪中含有不同程度的病原菌，直接施入土壤后，可能导致土传性病害。
2、使用前须发酵
鸡粪肥料在使用前，必须进行充分发酵，以杀死土壤中的有害真菌、细菌等微生物，以下是鸡粪发酵的常用方法：
1）鸡粪沼气池发酵法
在饲养场内建沼气池，将鸡粪送于池内生产沼气，可用于烧水煮饭或作为能源制作膨化饲料。发酵的粪便无臭味，沼气池中的粪肥应及时清出池外，用干制法或发酵法堆积贮存。
2）鸡粪塑料膜密封发酵法
在粪场的粪堆上盖上塑料膜，周围用土、石块压实，不透气，留出一端以方便掀盖。把每天打扫的鲜鸡粪加入，再压实，如果塑料膜幅面窄，可以互相压边，以水粘合，阳光照射发酵几天后，应经常掀开塑料膜晾晒。如果有蝇蛆孳生则盖上膜即可快速杀灭，反复一段时间之后，粪即干成堆。如果鸡粪肥长期不出售或不使用，则应用泥土封存好。
3）微生物发酵饲料或添加微生态制剂
利用微生物分解粪便中的臭素，喂10天后粪便无臭味，不仅可以提高生产效益，改善饲养环境，还有助于减少苍蝇孳生。