在巨峰葡萄的生长过程中，尤其在多雨的南方，连续阴雨，温度低湿度大，若管理不当，种植密度大，通风不良，极易得各种病虫害。
巨峰葡萄常见病虫害1、主要病害
主要包括细菌性病害酸腐病，以及真菌性病害：霜霉病、灰霉病、白粉病、白腐病、黑痘病、褐斑病、炭疽病、溃疡病和蔓枯病等。
防治药物：可以使用链霉素，烯酰吗啉，啶酰菌胺，多菌灵，苯醚甲环唑，丙森缬霉威等来防治病害。
2、主要虫害
巨峰葡萄的常见虫害分为三种：
（1）咀嚼式害虫：鳞翅目，天蛾类，幼虫危害叶片，鞘翅目，甲壳类，金龟子以成虫为害，叶片和果实。
（2）刺吸式害虫：同翅目，叶蝉类，粉虱类，主要危害叶片，半翅目，盲蝽类，叶螨类，主要危害，叶片，果实，果梗。
（3）锉吸式害虫：缨翅目，蓟马，主要锉吸，幼果嫩叶新梢表皮汁液。
防治药物：可以用吡虫啉、噻虫啉、氯氰菊酯、甲氰菊酯、灭多威、氯虫苯甲酰胺及毒死蜱等来防治虫害。