在给蛋鸭打疫苗时，必须选准部位来打，才能收到较好的防疫效果。
蛋鸭打疫苗的部位一般在颈部皮下（1/3处）或浅层胸肌处，不要在腿肌注射，尤其细菌苗的注射，更是如此。
1、错误的注射方法：在鸭子颈部皮下注射时，直接握住鸭头，注射器与颈部呈90°角进行注射。
2、带来的不良后果：疫苗注射到颈部肌肉内，注射后易引起鸭颈部肿胀，更会导致鸭群出现缩颈弯脖、精神不振、采食下降、消瘦、排黄绿色稀粪等症状。
蛋鸭需要打什么疫苗针对不同日龄的蛋鸭，应分别注射以下疫苗：
1、1日龄：注射雏鸭病毒性肝炎疫苗；
2、5日龄：第一次注射禽流感疫苗；
3、7日龄：注射鸭疫里默氏杆菌苗；
4、20日龄：第一次注射鸭瘟疫苗；
5、35日龄：第二次注射禽流感疫苗；
6、80日龄：第三次注射禽流感疫苗；
7、90日龄：第二次注射鸭瘟疫苗；
8、120日龄：第四次注射禽流感疫苗；
9、450日龄：第三次注射鸭瘟疫苗。