现代医学治疗：
一般护理：急性期宜卧床休息，按病情随时测脉搏、血压。按肠道传染病消毒隔离。饮食以流质或半流质为宜，忌食多渣多油不易消化或具有刺激性食物。给口服补液盐溶液(ORS)每立升水中含葡萄糖20克，氯化钠3.5克，碳酸氢钠2.5克，氯化钾15克。也可静脉滴注5%葡萄糖生理盐水，有酸中毒患者给碱性液体如碳酸氢钠等，腹痛剧烈时腹部置热水袋，也可给颠茄片(酊)或阿托品、654-2等。对腹泻与里急后重者可给复方樟脑酊，每次2毫升，每日3-4次。
抗菌药物：
1.SMZ-TMP：每次2片，每日2次口服。对有磺胺过敏，白细胞减少及肝、肾功能不全者忌用。
2.吡哌酸：每次0.5克，每日3-4次，连用5-7日。也可用氟哌酸，每次0.2克，每日3-4次口服。
3.卡那霉素：每次0.5克，每日3-4次口服或肌注。
4.庆大霉素：每日16-24万单位，口服或肌注。
5.硫酸抗敌素：每日1.5-2克。
6.氨基苄青霉素：每日2-4克分4-6次，口服或肌注。
以上药物可任选1-2种(最好根据药敏试验)，疗程均为5~7日。
中毒型痢疾：
抗菌剂宜静脉给予氯霉素、氨基苄青霉素、庆大霉素等。休克型忌用磺胺。休克型、脑水肿型宜参照中毒性休克与脑水肿的处理。
慢性菌痢：
抗菌宜联合应用，宜依据药敏选择，疗程宜长，有时需反复几个疗程。可用灌肠或直肠滴入法：尤其对肠道粘膜病变经久不愈者，宜在一般给药的同时，采用局部灌肠疗法，每次200-500毫升，每晚1次，10-14日为1疗程。常用药物有：①0.3%黄连素液；②0.1%卡那霉素溶液；③1：5000呋喃西林淀粉溶液；④5~10%大蒜溶液200毫升加强的松20毫克，还可配合免疫疗法，如用左旋咪唑，每次50毫克，每日3次，每周用2日。有条件者可用痢疾菌苗隔日皮下注射1次。以上均为10-14日为1疗程。
中医辨证分型治疗：
1.湿热蕴结(急性普通型菌痢)：
症状：急起发热，腹痛阵作，里急后重，下痢赤白，肛灼尿赤，舌质红，苔黄腻，脉滑数。
治法：清热解毒化湿，调气行血导滞。
方药：疫痢合剂。
葛根12克，白芍9克，黄芩9克，黄连6克，白头翁12克，木香6克，生甘草6克。
水煎服，1日1-2剂。
2.疫毒壅盛型(急性重型痢疾、毒痢)：
症状：壮热烦渴，腹痛剧烈，泻下鲜紫脓血，或面色苍白，四肢厥冷。舌质红绛，苔黄而干，脉洪数或沉伏。
治法：清热解毒，凉血益气。
方药：黄连解毒汤合生脉散加减。
水煎服，1日1-2剂。必要时鼻饲或直肠滴入、灌肠。
3.热毒内闭型：
症状：骤起寒战高热，头痛项强，神昏惊厥，血压升高，大便腥臭，秘结，舌红绛而干，苔黄腻，脉滑数或弦数。
治法：清热解毒，泻火开闭。
方药：葛根芩连汤合泻心汤加味。
生大黄12克(后下)，黄连3克，黄柏9克，栀子9克，黄芩9克，葛根9克，金银花15克，丹皮9克，赤芍6克，鲜石菖蒲9克。
水煎服，1日1-2剂。
4.脾肾阳虚型：
症状：久痢不愈，神疲畏寒，口淡食少，腹痛隐隐，下痢稀薄，舌质淡红，苔薄白，脉细弱。
治法：温补脾肾，固涩止泻。
方药：理中汤合四神丸加减。
党参15克，干姜9克，炒白术12克，吴茱萸12克，补骨脂12克，五味子9克，煨诃子9克，焦山楂9克。
水煎，早晚分2次口服，1日1剂。
5.阴血亏虚型：
症状：痢下赤白，口干渴，至夜转剧，舌红绛而干，苔光剥，脉细数。
治法：扶正止痢，益阴泻热。
方药：黄连阿胶汤合驻车丸加减。
阿胶15克，黄连6克，黄芩9克，白芍12克，当归12克，瓜蒌12克。
水煎，早晚分2次口服，1日1剂。
6.气滞血瘀型
症状：下痢已久，粪便夹有小血块，里急后重顽固，腹痛如刺固定不移，左下腹可按及硬结或索条状物，舌暗有瘀斑瘀点，苔白，脉细涩。
治法：行气化瘀，导滞止痢。
方药：少腹逐瘀汤加减。
桃仁10克，红花10克，归尾10克，赤芍10克，熟地20克，干姜10克，肉桂12克，元胡12克，五灵脂10克，蒲黄12克，木香10克，黄连10克，内金12克。
水煎，早晚分2次口服，1日1剂。