所有孩子几乎每次生病后，都会出现一小段时间的便秘。这通常是因为生病时孩子不太吃东西、饮水不足以及大量出汗。
母乳喂养的婴儿排便次数因人而异，而且大便通常比较稀软。而人工喂养的孩子则容易发生便秘，这是只喝某一种配方的奶粉造成的，可以更换奶粉的品牌或牛奶的配方。
如果婴儿出生后就出现持续性的便秘，可能是甲状腺素缺乏或先天性巨结肠引起的。这种情况比较少见，发病率大约为1/5000，一部分肠道问题是由于肠壁中的某一段缺少神经细胞，结果使肠管不能正常地收缩，从而导致便秘。这种情况还伴有腹胀和呕吐。
孩子一岁后，明显的便秘现象比较常见了，这主要是因为饮食发生了变化。当然，这也可能是一排便习惯训练的问题。孩子或许会讨厌排便，想尽量不这样做。他们可能是害怕一个人在厕所里，也可能是对解大便感到害羞，或者对排便过程中发生的事情感到焦虑。大一些的孩子也会不喜欢排便，特别是开始上学之后，他们有时只是不喜欢学校的厕所。
但是，有这些害怕解大便问题的孩子，不可能永远抑制住排便。结果，他们对大便变得又粗又硬，会使肛门的皮肤破裂（称为肛裂）。肛裂时非常痛，使得孩子更不愿意排便。这样就形成一个恶性循环：越不愿意解大便，大便就积聚得越硬越粗，结果排便时就疼得越厉害。孩子可能会不愿意吃东西，一些稀便还会从阻塞在肛门口的坚硬粪块周围流出来，造成大便失禁，这常常会使家长误以为孩子出现了腹泻，而不便秘。这种情况并不少见，但在治疗时却会使家长摸不着头脑??为什么孩子是腹泻的症状，却还要用泻药！
其他引起便秘的原因包括水喝得不够，特别是在孩子发烧的时候。另外，有些孩大便秘是由于食物中缺乏足够的纤维素。
不幸的是，有些家长矫枉过正，给孩子吃过多的纤维素。大夫们对此是不敢苟同的。大量的纤维，特别是补充性纤维或高纤维谷物，实际上对孩子来说是纤维过量了。孩子只要多吃新鲜水果、豆类、全麦面包等就可以了，不需要再补充额外的纤维素。
有些药物也会引起便秘。常见的有两种，一种是治疗缺铁性贫血的铁剂，它还会使大便变黑。另一种称为三环类药物，例如丙米嗪和阿米替林，这两种药物有时用于治疗孩子尿床。