一、红白锦鲤
红白锦鲤是锦鲤的代表品系，素有“锦鲤始于红白而终于红白”的说法，特征是白底之上有红色斑块，其中白色要洁白如雪，红色则要油润鲜红，代表品种有德国红白锦鲤、富士红白锦鲤、覆面红白锦鲤、二段红白锦鲤、三段红白锦鲤、四段红白锦鲤、金银鳞红白锦鲤、口红红白锦鲤、拿破仑红白锦鲤、闪电红白锦鲤、御殿樱红锦鲤等。
二、大正三色锦鲤
大正三色锦鲤是锦鲤的代表品系，指1900年的日本大正时代新泻地区的鲤师们在红白锦鲤的基础上培育出带有墨色斑纹的三色锦鲤，特征是头部只有红斑而无黑斑、胸鳍上有黑色条纹，代表品种有赤三色锦鲤、德国三色锦鲤、口红三色锦鲤、银鳞三色锦鲤、富士三色锦鲤等。
三、昭和三色锦鲤
昭和三色锦鲤是锦鲤的十三个品系之一，指上个世纪三十年代日本昭和时代培育出的锦鲤，特征是黑底上有红、白纹且胸鳍基部有黑斑，其中白位较少的昭和三色称作传统昭和三色，白位较多的则称为近代昭和三色，代表品种有、淡黑昭和锦鲤、德国昭和锦鲤、绯昭和锦鲤、代昭和锦鲤等。
四、写鲤
写鲤是锦鲤的十三个品系之一，特征体色以黑色为基底，黑底上面有三角形的白斑纹、黄斑纹或红斑纹，其中三角形斑纹呈白色的称作白写锦鲤，三角形斑纹呈金黄色的称作黄写锦鲤，三角形斑纹呈橙红色且胸鳍也有红色斑纹的称作绯写锦鲤，代表品种有白写锦鲤、德国写鲤、绯写锦鲤、黄写锦鲤等。
五、黄金锦鲤
黄金锦鲤是锦鲤的十三个品系之一，特征是全身只有金黄色，代表品种有灰黄金锦鲤、白黄金锦鲤、白金锦鲤、山吹黄金锦鲤、橘黄金锦鲤、绯黄金锦鲤、金松叶黄金锦鲤、银松叶黄金锦鲤、德国黄金锦鲤、德国白金锦鲤、德国橘黄金锦鲤、瑞穗黄金锦鲤、金兜锦鲤、银兜锦鲤、金棒锦鲤、银棒锦鲤等。
六、浅黄秋翠
浅黄秋翠是锦鲤的十三个品系之一，其中浅黄锦鲤是锦鲤的原种之一，至今约有160多年的历史，而秋翠则是1910年五郎氏用德国鲤和浅黄三色杂交形成的，代表品种有绯秋翠锦鲤、绀青浅黄锦鲤、花秋翠锦鲤、鸣海浅黄秋翠锦鲤、浅黄三色锦鲤、水浅黄锦鲤等。
七、衣鲤
衣鲤是锦鲤的十三个品系之一，实际上是红白锦鲤或三色锦鲤和浅黄锦鲤杂交形成的，特征是红斑下的鳞片上有蓝色、深色甚至葡萄色等颜色，代表品种有蓝衣锦鲤、墨衣锦鲤、葡萄衣锦鲤、衣三色锦鲤、衣昭和锦鲤、衣丹顶锦鲤、德国衣鲤等。
八、别甲锦鲤
别甲锦鲤是锦鲤的十三个品系之一，特征是体色以白色或红色为基底，背部分布有小块墨斑如同一块块甲片，其中白底色的称作“白别甲”，红底色的称作“赤别甲”，代表品种有白别甲锦鲤、赤别甲锦鲤、德国别甲锦鲤、黄别甲锦鲤等。
九、花纹皮光鲤
花纹皮光鲤是锦鲤的十三个品系之一，凡是写鲤以外的锦鲤与黄金锦鲤杂交产生的锦鲤均可称作花纹皮光鲤，代表品种有贴分锦鲤、山吹贴分锦鲤、桔黄贴分锦鲤、贴分松叶锦鲤、德国贴分锦鲤、菊水锦鲤、白金富士锦鲤、大和锦锦鲤、锦水锦鲤、银水锦鲤、松竹梅锦鲤、孔雀黄金锦鲤、虎黄金锦鲤等。
十、光写锦鲤
光写锦鲤是锦鲤的十三个品系之一，别称写皮光鲤，指写鲤和黄金锦鲤杂交产生的后代，特征是多具有金属光泽，代表品种有金昭和锦鲤、银昭和锦鲤、银白锦鲤、金黄写锦鲤、孔雀光写锦鲤等。
十一、金银鳞锦鲤
金银鳞锦鲤是锦鲤的十三个品系之一，特征是全身有闪闪发光的金色或银色鳞片，其中鳞片在红色斑纹上呈金色光泽的称作金鳞锦鲤，鳞片在白底或黑底上呈银色光泽的则称作银鳞锦鲤，代表品种有金银鳞红白锦鲤、金银鳞三色锦鲤、金银鳞昭和锦鲤、金银鳞别光锦鲤、金银鳞皮光锦鲤。
十二、丹顶锦鲤
丹顶锦鲤是锦鲤的十三个品系之一，在众多锦鲤中丹顶锦鲤最受官宦人士青睐，素有“官鲤”之称，特征是通体雪白、只有头顶正中有一红色圆斑，代表品种有丹顶红白锦鲤、丹顶三色锦鲤、丹顶昭和锦鲤、丹顶五色锦鲤、丹顶孔雀锦鲤等。
十三、变种锦鲤
变种锦鲤是锦鲤的的十三个品系之一，指锦鲤在繁殖和杂交过程中改变了原有特征形成的新品种，按锦鲤的13种分类法除其他12种锦鲤外都是变种鲤，代表品种有乌鲤、黄鲤、茶鲤、绿鲤、松叶锦鲤、九纹龙锦鲤、五色锦鲤、三色秋翠锦鲤、昭和秋翠锦鲤、五色秋翠锦鲤、鹿子红白锦鲤、鹿子三色锦鲤、鹿子昭和锦鲤、影写鲤、影昭和锦鲤等。