一、条鳅亚科
条鳅亚科是鳅科下属的一个亚科，下属物种统称条鳅，约有36属共554种，广布于亚洲、欧洲、北非等地，我国是条鳅资源最丰富的国家，现已知有14属约91种，常见种类有大斑条鳅、纵纹北鳅、横纹条鳅、斯氏高原鳅等，其中似鲇高原鳅是体型最大的条鳅，体长可超过60厘米、体重可达1.5千克以上。
二、沙鳅亚科
沙鳅亚科是鳅科下属的一个亚科，下属物种统称沙鳅，约有3属共42种，我国有3属共27种，广泛分布于北亚、东亚、南亚、东南亚等地，我国主要分布在长江以南各地，常见种类有花斑副沙鳅、中华沙鳅、长薄鳅等，其中长薄鳅是体型最大的沙鳅，最大个体可达40厘米以上。
三、花鳅亚科
花鳅亚科是鳅科下属的一个亚科，下属物种统称花鳅，约有15属共25种，我国有6属共12种，广泛分布于亚洲、欧洲、北非等地，我国除青藏高原外全国各地普遍都有分布，常见种类有泥鳅、中华花鳅、大鳞泥鳅、大鳞副泥鳅等，其中泥鳅是体型较大的花鳅，最大个体可达30厘米以上。
综上所述，鳅科下属条鳅亚科、沙鳅亚科、花鳅亚科三个亚科，条鳅亚科约有36属共554种，沙鳅亚科约有3属共42种，花鳅亚科约有15属共25种，本科最具代表性的物种有中华沙鳅、泥鳅、中华花鳅、大鳞泥鳅、大鳞副泥鳅等。