古时，有大山之神，主管草木万物，名“比央朵明热巴”，该神有九个女儿，个个美貌贤惠、勤劳、善良，然而神则恨女难成大器。又害怕女儿们嫁人归去，自己孤身难待来日，于是便于水晶般大岩中，选出秀丽舒适的楼阁庭院，锁女于其中，不让她们外出。
姑娘们深感父爱，又望出秀楼创世界。父亲不允许，左右为难，且山门难出，思来想去，决计变为蜜蜂随父进出。大姐首当其冲，附于父体，化为蜂，学得父亲开、关山门的方法，一天便趁父亲外出，领众妹妹化为彩蝶出山门翔于蓝天。
时值正午，姑娘们来到十二山峰上空，看见地上沟谷纵横，毒烟四起，生灵涂炭。细寻，见清流污水染就，民饮水而病、亡，鸟兽亦遭其害。九位姑娘访得一病危老妈，老妈劝姑娘快快离开此地，道有妖魔叫“蛇魔扎”，言欲收杀十万生灵，方能得道成仙，天下无敌，溪流中全为妖魔所投毒物。
姑娘们听了此话，恍然明白阿爸近日愁颜原委，便问老妈，“如此妖魔，比央朵明热巴为何不管？”老妈言道：“他呀，几次都败给妖魔了”。姑娘们闻言，大惊失色，急忙返回家。
阿爸已知女儿们出去了，却不言语，苦思败魔绝招。姑娘们则聚于屋中，共同商量灭妖大计。大姐很聪明，对众妹妹说道：“阿舅本领超常，阿爸的本事也是他教的，何不请他灭妖？”主意已定，众姐妹又叹不知阿舅住在何方。于是，大姐从答爸房中偷出图纸，约众姐妹，化为九条飞龙，直往西天而去。路径千难万险，终于来到一处烟波浩淼的别洞前。姑娘们仰首观望，半空祥云处显出天神模样之人，就是金刚降魔神雍忠萨玛，姑娘们的舅舅。
舅舅见了它们，明了事情原委，取出玉石绣花针筒、绿色宝石一串，赐给姑娘们：这针筒是你们阿妈炼成的“万宝金针”，遇见蛇魔扎，只要把金针筒对着妖魔叫声你们阿妈的名字，万根金针就会刺破妖魔的眼珠和心脏；若还不行，你们又连叫三声我的名字，我即来协助你们。妖魔死后，你们将这绿宝石串珠撒向十二座山峰，便会使山沟翠绿一片。
姑娘们记牢舅舅的话，回到山峰脚下，战败了蛇魔扎，但此妖顽冥不化，垂死中将地上的污水卷起巨浪，冲毁了良田房舍……姑娘们见此情景，急呼舅舅名字，突然天空霹雳一声，一面闪射金光之大镜插于洪水前，洪水立即消失，而恶魔的头，血淋淋的挂在宝镜前。姑娘们即跪拜谢舅舅。此时，比央朵明热巴急得浑身汗湿，飞到十二山峰下一看，大喜过望，也明了大半，欣喜之余，连夸女儿们能干。
随后，姑娘们将绿宝石全都撒向十二山峰下，刹时，山青水秀，林木苍翠。宝石落地砸出的坑成了海子，线则成了溪流瀑布。
后来，九个姑娘分别嫁给了九个强壮的藏族青年，他们分别住在九个藏族村寨里。于是，后人便称此地为九寨沟。