瑶族的宗教信仰因地而异，有自然崇拜、祖先崇拜，也有图腾崇拜；还有些地区信仰巫术和道教。
原始宗教
瑶族的宗教信仰主要是原始宗教。祭祀寨神、家神、水神、风神、林神、猎神；对生产中的每一个过程如砍山、耕地、撒种、栽秧、收稻谷、吃新米、建仓等，都要占卜吉日，祭祀各种神灵。部分瑶族(主要是“蓝靛瑶”)信仰道教，见婚丧、疾病以及日常生活中所遇到的事物，都用阴阳五行的观点加以解释。他们主要祟拜“盘瓠神”(“蓝靛瑶”称“奔翁”)；此外，还祭献“伏羲姐妹”、“神农”(单龙)、“社皇”(里出)、“庙老”(扭古)、“赵翁”(灶王)、“王皇”、“杨六朗”、“四大元帅”、“解秽娘子”、“五龙”、“羽宫”、“冯二秀才”、“九娘”，“五雷”等四十多个神诋。这些神诋都没有偶像，但都有它们的来历和传说，如“解秽娘子”是专管婚姻之神；“羽官”是聪明智慧之神；“冯二秀才”是传说中瑶族人民的钟画家；“五雷”是死难者之神，“五龙”是与自然作斗争的英雄之神。多数神抵，有世代相传的祭文，祭文以诗写成，七字一句，句尾押韵。
“度戒”
瑶族还有很多宗教风俗习惯。“度戒”(或称“过法”)是其中最主要的一种。每个男子通常在八、九到十六、十九、二十二岁时，都要举行一次“度戒”仪式。“红头瑶”称之为“度鳃”，“篮靛瑶”称为“栽奢”，“沙瑶”称为“在”，富宁部分瑶族称为“者三”。“度戒”有戒师主持，先由戒师看“大同书”、二十八宿、六十甲予以择日举行。瞪戒"仪式有“大度”、“小度”或“度天戒”、“度地戒”之分。“大度”通常由七个戒师主持，“小度”通常由五个戒师主持。“度戒”期间，该男子须在戒师家吃、住，不能出门，不可见天，走路时须戴帽低头，除戒师之外，他人不得与之讲话，不得吃油荤食物。
入夜，方由戒师传授各种宗教仪札和课目，如背颂宗教经典和本民族、本家族的历史等。“度戒”仪式在村寨附近的草坪上举行，度时先搭一巫台(“蓝靛瑶”称“窝来”)于草坪上，然后由戒师将“度戒”之人引上巫台，并由戒师念经请神，诸神和众人既至，戒师使领“度戒”者对天发誓：不杀人放火，不偷盗抢劫，不奸女拐妇，不虐待父母，不陷害好人，不做官欺人等等。誓毕，戒帅掇火于水碗内，表示如有违誓，命运将如同火入水而火。然后，戒师即喊一声“度下!”“度戒”者随即全身卷曲，两手指交叉紧扣膝盖，置头于两膝之中，从巫台上一滚而下，台下有八人预先投一藤网接应，从巫台“度下”时，若两手松脱，四肢朝天，则不仅被人耻笑，且被认为“功德修得不圆满”，没有“过关”，“神鬼不灵”，是一件终身的憾事。“度戒”后，由戒师宣读日后所应遵守之法纪，加盖手印，由“度戒”者保存至死。“度戒”在瑶族男子中有着成丁札的意义。经过“度”和“度戒”“过关”者，日后便可继续与师父学习经文礼仪和其他道德训条，井受到社会尊敬，还被认为可以得到神灵保护；反之，则没有社会地位，不能取得姑娘的爱慕，甚至难以找到老婆；年长者如未举行此项仪式，一定时候需要补行，否则被认为“不是瑶家人”。
长期以来，“度戒”已成为瑶族人民训诫孩子应该如何做人的教育形式，而且在瑶族社会生活中占有极为重要的地位。瑶族男子命名有两次，一为乳名，一为法名；法名即“度戒”后由师父所取之名，此法名平时他人不得乱减，唯有师父才能呼喊。瑶族有“拜寄”习惯，即小孩生病时，父母便认为自己命薄，须再拜寄他人为“干爹”、“干妈”为之“保全”，拜寄时先在门前插香，三日后先来客人为“干爹”、“干妈”，并为小孩另取新名，以示解脱病灾。
“预兆”
各地瑶族都习惯用宗教迷信观点把梦中的情景解释为事物的“预兆”。如入睡时梦见太阳落山，即认为父母将遇小灾；梦见滚木下山，预兆即将发财；做梦唱歌，预兆将与他人斗口角；梦见风、雨，吃肉，大蛇追咬，认为将有灾患病等。此外，禁忌也甚多，如：“祭龙”期间不得动土，正月初一妇女不能串门；初三、初五、初六不出门，“出门多病”；屋内火塘中的铁三脚不能用脚踩，家有产妇不满一月，外人不能穿草鞋进门；平时不能坐门槛等。瑶族有纯朴的民间道德传统，史籍记载，瑶族“好洁”(干净)，每有客人到家，客人首先须与妇人招呼，“主人乃乐，否则反谓客人傲慢，轻视彼族”(民国《马关县志》卷二)。平时路遇老人，必须让行，若是骑马，必须下马，老人背负重物，须替老人背物，路上相遇，无论认识与否，都要热情招呼。
蓝靛瑶的教戒
散居在广南、富宁等地自称“金门”、汉称兰靛瑶的瑶族，有一种美好的传统习惯叫“教戒”。瑶家青年结婚，都要经受“教戒”仪式，表示夫妻生活的开始。“教戒”内容十分广泛，有孝敬父母的，有尊重亲友的，有劝导夫妻和睦相处的，有劝导节俭度日的，等等。随着时代的进步和发展，“教戒”的内容也发生了新的变化，有的媒公还能根据党的政策和形势的要求，增加新的劝导，如“兄弟要团结，各族是兄弟，团结力量大，才能搞四化”，等等。