南京现存的城门，主要始建于明代。随着历史长河的流淌，这些城门有的保留，有的毁弃，有的变更。这一座座城门见证了时代的变迁发展和历史的沧桑。
这13座城门分别为：
城东—— 朝阳门（今中山门）；
城南—— 正阳门（今光华门）、通济门、聚宝门（今中华门）；
城西—— 三山门（今水西门）、石城门（今汉中门稍南的汉西门）、清凉门（又称清江门）、定淮门、仪凤门（今兴中门）；
城北—— 钟阜门、金川门、神策门（今和平门）、太平门。
朝阳门（今中山门）
1366年（元至正二十六年），朱元璋向东北两面拓展南京城时修筑朝阳门。城门为单孔券门，门外还有一道。此门是瓮城连接城内的宫城和城外的明孝陵的通道。之所以叫朝阳门，是因为它位于城东，最先迎接太阳。
可惜，朝阳门已经不存在了。我们现在看到的是在朝阳门旧址上重建的中山门。
这还与孙中山先生有关，1928年（民国十七年），国民政府为迎接孙中山灵柩，兴建中山大道时，将原朝阳门拆除，把门基挖低，修造三孔拱形砖门，并在门洞上嵌“中山门“的题字石额，通向中山陵的大门，并沿用至今。
抗日战争爆发，中国守军曾在此展开惨烈的南京保卫战。1996年，南京中山门成为沪宁高速公路进入南京城的入口，与城门外的金陵辟邪成为南京城的主要象征之一。
正阳门（今光华门）
正阳门是内外均为瓮城的复合型瓮城，对城内城外有双重防御作用。为古代建城史独创，在中国城墙建造史上独一无二，非常罕见。是南京京城的正门，位于御道街最南端。
1931年（民国二十年），国民政府为纪念辛亥革命江浙联军由此进入光复南京城，易名光华门，喻光复中华之意。次年4月由国民政府监察院院长于右任题写“光华门”匾额镶嵌于城门之上。
曾经的光华门染尽了鲜血，1937年12月的南京保卫战，光华门是战斗最激烈、伤亡最大的一座城门，在战火中，城门被炮火炸塌。
抗战结束后，国民政府南京市工务局修补了被日军炸毁的城墙豁口。解放后的光华门已经破败不堪，1958年的时候被政府拆除，如今光华门只剩下城门遗址和城门命名的地名。
通济门
通济门是南京13座内城门中规模最大的城门。它坐北朝南，有3重内瓮城。进门向东北而去是森严的皇宫区，向西南而行则是热闹的秦淮商业区，堪称南京的咽喉要道。
通济门内部结构极其繁复，其形状在中国绝无仅有，一座城楼，两条上城马道和人行道，三座瓮城，四道门垣皆为拱券砌筑，以及若干瓮洞，瓮城周长约690米，立面城宽约90米,均为条石砌筑，比现存最大的瓮城聚宝门（今中华门）还要大。
但是这座世界城墙史上独一无二的杰作，还是在50年代的拆城运动中不可幸免。
1963年底，通济门及瓮城地面建筑被彻底拆除。从此，屹立了近600年的通济门瓮城消失在人们的视野中。1963年，通济门城墙最后的石墩被清除。只剩下地名沿用至今。
聚宝门（今中华门）
聚宝门现在叫中华门，是中国现存规模最大的城门，世界上保存最完好、结构最复杂的堡垒瓮城。当然如果通济门还没有拆毁的话，论建筑规模中华门是不及的。
中华门的历史可追溯到南唐国都江宁府和南宋陪都建康府城的南门，1369至1375年在其扩建而成，那时还叫称聚宝门。1931年的时候，国民政府把聚宝门改为中华门。
这里值得注意的是，明代在建造聚宝门的时候，每块砖上都在侧面印有制砖工匠和监造官员的姓名。这是朝廷为了保证城墙砖的质量所想出的对策，一旦发现不合格的，立马就可以追究责任。
所以中华门在这600多年，即使是经历了朝代的更迭，战争的炮火，但它依旧保存完好。
三山门（今水西门）
三山门之前不叫三山门，其历史可追溯到南唐都城以及宋、元金陵城的龙光门，1386年（明洪武十九年）重新建造，因南眺三山故才改名为三山门。
三山门是旧日从水路进出南京城的主要通道，面临秦淮河，为水陆两栖城门。后称为水西门。
1953年南京市人民政府拆除了三山门瓮城和水西门水城门，1958年又拆除了残存的城门和城墙，1959年三山门门券及右侧城墙拆除后，内外秦淮河水系不再贯通，古亭都被拆除，仅留水西门的地名，沿用至今。
三山门外有三山桥，也就是觅渡桥，清代康熙年间建造，壕水径此，与城内淮水合。
石城门（今汉中门稍南的汉西门）
石成门位于民国时期增辟的汉中门以南，现位于南京汉中门广场内。旧时为南京城城防的锁钥，兵家必争之地。
石城门又称汉西门，老百姓喜欢称之为旱西门。1997年，南京市政府加固修缮石城门部分瓮城，同时将这一带改造成市民广场，供人游览、休憩，并命名为汉中门广场。所以石城门现在在汉中门广场里面。
其是石城门的历史比明城墙更悠久，据说早在杨吴天祐十二年（915年）建造金陵府城时，位于城西的这座城门已具雏形，那时名为大西门。
经南唐的改扩建，再历时宋元，4个朝代、400余年的“承上启下”，至朱元璋建明城墙时已具规模查阅《南唐江宁府图》、《宋建康府图》和《元集庆路图》，这400余年间只是名称略有改动，大西门演变成了“西门”。
此门以北里许，就是南京著名的石头山（今称清凉山），山上有东周楚国的金陵邑城和“金陵第一帝”孙权在故址上修筑的石头城。登上城门楼，石头城一览无余。明朝统治者寄希望于这座城门能够像当年石头城一样坚如磐石，固若金汤，于是将大西门易名为石城门。
现在，石城门周围的广场上经常有来往不绝的市民。倒也让这个名字变化颇多，坚如磐石的古城门不显寂寞。
清凉门（又称清江门）
清凉门是明代南京内城十三座城门之一，因坐落在清凉山得名，坐东向西，现由一道城门和一圈椭圆形瓮构成，城门楼上的城楼已经不存在，城顶上存留一块绞关石，上凿有两个绞孔，瓮城呈半圆形，正对城门，坐北朝南。
据史载，该门建成不久，即被堵塞，600多年没有使用。2006年翻新修建的外秦淮河清凉门大桥继续以清凉门的名称命名。
清凉门曾经改名为清江门，后来又改成清凉门。
定淮门
定淮门位于南京西城墙上，明代以前原名马鞍门。明代洪武7年（1374年）改名为定淮门。清代道光23年（1843年）由于外秦淮河淤塞而废用定淮门。
1958年，定淮门被南京市人民政府拆除。现在原城门遗址只保留了定淮门的地名，现在城门外建筑有定淮门大桥同南京河西地区相连接。2015年9月，南京因模范西路快速改造发现定淮门遗址。
据说明代的时候定淮门是一个很偏僻的地方，当龙江宝船厂迁过来之后定淮门尤其热闹。江苏、江西、浙江、福建、湖南、广东六省船厂全部迁来此处。
600年前这里建造了200多艘排水量巨大的木帆船。这些排水量超过千吨的巨型宝船就是在这里出厂，陪伴着三宝太监经历了七下西洋的惊涛骇浪，最终毫发无伤，满载而归，重回天朝。
仪凤门（今兴中门）
仪凤门建于明代洪武初年，因为地处长江南岸，卢龙山下，仪凤门是进入南京城的要道，军事位置十分重要。传说仪凤门曾被封堵达200年，到了1659年才得以重建。清朝仪凤门为单孔城门，上设两层箭楼。
清光绪二十一年（1895年），时任两江总督张之洞在仪凤门下铺设了南京第一条近代马路。
当时的官员们北上、出征，都走这座城门；遇到打胜仗，附近的百姓就会在仪凤门附近设很隆重的仪式欢迎凯旋的将士们。
民国十年（1921年）修造挹江门，仪凤门的地位显著下降。
民国二十年(1931年)，国民政府改仪凤门为兴中门。
1971年，由于建宁路的修建，兴中门被拆除。
2006年，南京市政府复建仪凤门，为一三孔拱门。
钟阜门
钟阜门介于金川门、仪凤门之间。城门坐西向东，几乎和仪凤门相对，也是两座距离最近的城门。两座城门取龙凤呈祥寓意。因其遥对钟山（亦称钟阜）而得名。由于城门朝东，俗称小东门。
明洪武十一年(1378年)改名为钟阜门。明成化年间，因守备兵力不足而被堵塞，不过它没有仪凤门幸运，堵塞之后就一直未被开通。
1958年，南京市人民政府决定拆除该段城墙，现仅存地名。它是南京最早被拆除的城门之一。所以这座城门的存在渺小的微乎其微，也只是在历史上轻描淡写。
金川门
金川门，是南京明城墙的十三座明代内城门之一，介于钟阜门、新民门和中央门、神策门之间。金川门坐南朝北，面临护城河，因金川河由此出城（旧有金川门涵洞）而得名。
金川门外设有金川桥一座，城门附近设置有水闸，控制护城河和外金川河的流通。
1930年代金川门曾改名三民门。
民国三十一年(1942)五月，疏浚金川河，又改建涵洞11座。金川门的威武雄姿依然矗立在南京城北，傲视四周。
1957年由于交通道路改造的需要，三民门及宁省铁路（京市铁路）一同被人民政府拆除，从此金川门实体退出历史舞台。
2004年金川门附近建起了市民广场，南京市人民政府在金川门遗址上竖立标志用来纪念。
神策门（今和平门）
是明城墙保存最为完整的一座，也是所有城门中唯一保留有民国以前镝楼的城门，它也是南京明城墙中唯一的一座外瓮城。相关传说是民间顺口溜一则：“内十三，外十八，一个门栓朝外插。”这个被人形容为“门栓朝外插”的城门指的就是明代南京神策门。
神策门虽是军事要塞，但由于地处荒僻，少有人烟。明、清、民国时期基本闭而不用。民国时，神策门被改名为和平门，门上匾额就是民国时期的。
1956年被南京军区设为军队油库，和平门油库的功能持续了70年。在这70年里，神策门成为了神秘的军事禁区，禁止市民参观。2001年，南京军区将和平门油库转交南京市人民政府，现已开辟为神策门公园。
神策门被誉为南京“最神秘”的城门，七十多年的封闭史直到2004年才对游人开放，这座保存最为完好的城门才得以大白天下。她至今仍然拥有镝楼和城门的木门，是南京明代内城诸城门中绝无仅有的。我们今天有机会漫步在神策门上，追寻六百年前的金戈铁马、峥嵘岁月是何其幸运。
太平门
太平门，位于南京城东北垣，是明代京城的正北门，以南是朝阳门（今中山门），西北方向是神策门。因为城门外是天牢，时常传出囚犯的哀呼之声，老百姓希望城内太平和谐，所以取名“太平门”。
1911年（清宣统三年），徐绍桢率苏浙联军由太平门光复南京，城楼在战火中被炸毁。1928年（民国十七年），国民政府《首都计划》里曾拟改名自由门，后被废弃仍用原名。
太平门是扼守钟山通向城内最近的通道，历来是兵家必争之地。太平天国时，在门外钟山脚下修筑地堡城、山上筑天堡城拱卫太平门，这两个要塞陷落后，清军在龙脖子用地道炸开城墙，攻入南京。1911年辛亥革命时的江浙联军也是攻占天堡城后攻入南京。
太平门段城墙的拆毁，是从1955年开始的，1958年被拆除。当年拆除该段城墙260米，至次年又追加100米，先后拆除长达360米的城墙。
现在的天平门曾经走了一段不太平的路。它经历了未报先建之后的争议叫停和调整之后，终于出现在人们眼前。但是我们现在看到的太平门并没有连接明城墙，而是一座独立的仿古建筑。