台湾民众崇拜之神，首推天后妈祖，其次是保生大帝。据传说，保生大帝即宋代福建同安白礁的神医吴本。台南学甲镇“慈济宫”供幸的吴本神像据说是由郑成功的同安部属从故乡白礁的慈济宫直接“分香”而来，地位之尊，有如北港妈祖。
1920年以前，每年农历三月十五的保生大帝诞辰日，学甲镇民要派出一批代表，恭随保生大帝神像返福建同安白礁乡参加盛大祭典。
1920年以后，日本官方下令断绝台湾海峡两岸交通，保生大帝回乡祭祀之举便改为在台湾本岛遥祭。
由于从学甲到白礁需4天海程，为了让保生大帝按时返乡参与三月十五日祭典，台湾民众就把为保生大帝“送行”的日期定为三月十一。学甲镇外出谋生者必须于三月十一前赶回学甲，否则便被乡亲认为“忘祀”，或者以为他在外没出息，“无颜见江东父老”。
具体的祭典仪式为“三月十一那天，全台各地保生大帝庙的信徒纷纷抬着“分身”神像来到学甲，香客总数可达二三十万之众，分锣鼓队、蜈蚣阵、宋江阵等等。人们先抵慈济宫参拜保生大帝，然后循着300多年前祖先的足迹前往4公里外的头前寮 （即郑成功部下当年携保生大帝神像登陆之地）集中，所有保生大帝的神像集中于此，由道士作法，宣读祭文，意谓送保生大帝前往白礁参加祭祀。然后大队人马又随神像回到学甲将军溪畔广场，那里搭好的祭台上供奉着炎帝、黄帝等中华民族列祖列宗的神像，主祭和陪祭人员率众祭拜民族祖先，恭读祭文。之后随即举行遥拜白礁慈济宫祖庙仪式，向西行三鞠躬礼，祈求保生大帝将大家的虔诚心意带回故土。
再往后是“请水”仪式，由主祭道士在将军溪中取一瓢清水，恭敬捧着众队随后，奉回慈济宫供奉于神案上，此乃表示饮水思源之意，参与祭典人众回到镇上，已是华灯初上，夜幕低垂。接下去是各家摆酒宴请亲友与香客、如此热闹的庆典达四五天之久。这种隆重而虔诚的庆典，在我国民俗中亦属罕见，从中可见台湾同胞对祖国眷恋之一斑。